由于未经处理的冬虫夏草由于细菌、霉菌甚至寄生虫的滋生、水分含量高等原因，在贮存时极易变质、蛀空、发霉，不仅不再具有药用价值，还会对身体产生危害。研究表明，霉变的物质会导致肝癌及消化道癌症的发生率明显升高，即使用白酒、酒精浸泡也去不掉，洗晒更不可能消除，绝对不能再食用。从药效上来说不仅药效已经丧失，更重要的是，即使去掉表面霉斑，内含的黄曲霉素也去除不掉。黄曲霉素是一种强致癌剂，动物实验证明，黄曲霉素致癌所需时间最短只要24周，具有比较稳定的化学性质，只有在280℃以上高温下才能被破坏。建议对于昂贵的冬虫夏草一定要注意其保存方法，通常虫草的湿度最好保持在5%-8%之间，冷藏保存最佳。
