三叉神经痛号称“天下第一痛”，其症状与牙痛症状极为相似，非常容易让人混淆、误诊，常常被当做牙痛去看牙科，很多患者以为拔牙可以缓解疼痛，殊不知却耽误了及时正确的诊治。三叉神经痛常发作是在口唇、口角、鼻翼、上颚或口腔黏膜等颜面部位，出现反复发作的阵发性剧痛。因此，轻度症状时常常会被误以为牙痛，患者甚至盲目的去拔牙，以为可除去病根，其实是大错特错。
血管压迫，有80%-90%的原发性三叉神经痛三叉动脉压迫。它也被提出，由于颈内动脉管顶是由一层薄薄的结缔组织所取代，从而在半月神经节腹动脉的搏动长期密切接触，产生压力，引发三叉神经痛。
机械压迫，一些学者提出了三叉神经，三叉神经根是由压缩引起的岩脊。结果发现，在绝经后妇女的三叉神经痛，这可能是由于骨质疏松，骨质脱钙，逐渐颅底凹陷症。和颅底是三叉神经痛的原因的主要因素。
缺血，因三叉神经痛多见50岁以上的老年人，易合并动脉粥样硬化和脑缺血。因此有人提出，三叉神经痛的发作是由于三叉神经细胞由于反复缺血;
三叉神经痛还可能是损伤或病毒感染引起的，所以感染理论，有降低胃酸，消化蛋白质的患者最多，产生组胺和组胺物质(如蛋白质)三叉神经和三叉神经神经性水肿疼痛理论。此外，还有人认为三叉神经痛与家族性倾向，与遗传有一定的关系。
综上所述，除了小部分是由于颅内肿瘤所致外，约80%的患者因颅内动脉迂曲的三叉神经根的压迫，产生异常的疼痛从传入冲动增加所导致的。也就是第一点所阐述了血管压迫。对于这种病因的三叉神经痛患者，治疗措施也可以根据病因确定。
空军军医大学唐都医院功能神经外科所运用的微血管减压术就是应用显微外科技术，将颅内迂曲的压迫血管从三叉神经根部分离，并用某种材料将血管与神经分开，达到既保留面部正常感觉，又消除疼痛的目的。同时，微血管减压术还是一种微创手术，手术不伤害面部的任何神经组织，保留神经完整性及其功能性。
